Программаторы J-Link для ARM работают с интегрированными средами разработки, такими как IAR EWARM, ADS, KEIL, WinAVR, RealView. Например, для J-Link V8 ARM USB-JTAG после подключения к компьютеру нужно установить драйверы (если операционная система не смогла найти их автоматически) и скачать среду разработки. После установки программного обеспечения к программатору можно подключать процессоры или отладочные платы через 20-пиновый JTAG-разъём.